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Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields

EBOOK IN LINGUA STRANIERA

Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields

di Jianzhu Ma (Autore)

Sheng Wang (Autore)

Jinbo Xu (Autore)

Springer, 2015

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Descrizione

This work covers sequence-based protein homology detection, a fundamental and challenging bioinformatics problem with a variety of real-world applications. The text first surveys a few popular homology detection methods, such as Position-Specific Scoring Matrix (PSSM) and Hidden Markov Model (HMM) based methods, and then describes a novel Markov Random Fields (MRF) based method developed by the authors. MRF-based methods are much more sensitive than HMM- and PSSM-based methods for remote homolog detection and fold recognition, as MRFs can model long-range residue-residue interaction. The text also describes the installation, usage and result interpretation of programs implementing the MRF-based method.

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Dettagli

Autore:

Jianzhu Ma, Sheng Wang, Jinbo Xu

Anno edizione:

2015

Editore:

Springer

Formato:

EPUB2 con Adobe DRM

Testo in en

Compatibilità:

Tutti i dispositivi (eccetto Kindle) Scopri di più

Layout:

Reflowable

EAN:

9783319149141

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