Sono passati tre giorni da quando i nostri eroi sono tornati dal terzo mistero scolastico, l'Inferno degli specchi. Per tirare su di morale Ko, che ancora non si è ripreso, Nene decide di portarlo a un festival per il Tanabata organizzato all'interno di un'area di dominio. Anche se la ragazza vuole divertirsi in compagnia di Hanako e Ko, a un certo punto si ritrova indietro nel tempo di cinquant'anni. Ed è proprio in questa situazione che Nene incontra Hanako... quando lui era ancora in vita!

I Sette Misteri sono celebri leggende urbane giapponesi legate alla scuola e una delle più note è quella di Hanako, il fantasma di una ragazza che infesta i bagni dell'Accademia Kamome e che, secondo le voci, realizzerà ogni desiderio del fortunato che riuscirà a evocarla. Quando Nene Yashiro tenta l'impresa di scovare Hanako, alla ricerca di aiuto in amore, scopre però che la "ragazza" in realtà è... un ragazzo! La studentessa finisce così coinvolta in un'avventura mistica nella quale, come assistente di Hanako, scoprirà quanto può essere fragile l'equilibrio tra il mondo mortale e quello degli spettri!