Sono passati vent'anni da quando l'apocalisse atomica ha cancellato la civiltà dalla Terra. Come le altre metropoli del pianeta, anche Milano è un cumulo di macerie in cui gli scampati alla distruzione sopravvivono sottoterra, nelle gallerie della vecchia rete metropolitana, divisi in comunità e perennemente in lotta per il controllo delle poche risorse disponibili. John Daniels, giovane seminarista ai tempi della catastrofe e già protagonista de Le Radici del Cielo, dovrà cercare, fra le comunità che popolano la metro milanese, nuovi alleati per la sua crociata contro il Male. Daniels, infatti, ha una missione da compiere: distruggere con una bomba il disumano fanatismo che si è annidato tra i resti della cattolicità romana, nelle Catacombe di San Callisto. L'inattesa piega degli eventi, però, costringe il sacerdote a Milano per recuperare l'ordigno sottrattogli dai Figli dell'Ira, un nemico potente e crudele che terrorizza i gruppi di sopravvissuti della desolata provincia lombarda. Con La Crociata dei Bambini Tullio Avoledo aggiunge un tassello importante all'universo espanso di Metro 2033, fantascienti co mondo interattivo creato dallo scrittore russo Dmitry Glukhovsky. )